Kursdetails
Überblick
Dieses intensive fünftägige Praxistraining bietet eine strukturierte Einführung in die Analyse von Omics-Daten und deren integrative biologische Interpretation.
Der Kurs deckt die wichtigsten Omics-Bereiche ab: Genomik, Transkriptomik, Proteomik, Metabolomik, Multi-Omics-Integration, Systembiologie, öffentliche Omics-Repositorien, RNA-seq-Analyse, differenzielle Genexpression, Pathway-Enrichment, Visualisierung von Proteomik- und Metabolomikdaten, Interpretation biologischer Netzwerke, Biomarker-Identifizierung, Präzisionsmedizin sowie KI-getriebene Zukunftstrends in der Omics-Analyse.
Die Teilnehmenden sammeln praktische Erfahrung am Computer mit realen Omics-Datensätzen und lernen, komplexe biologische Daten zu analysieren, zu visualisieren, zu integrieren und zu interpretieren.
Lernziele
Nach Abschluss des Workshops sind die Teilnehmenden in der Lage:
- die wichtigsten Omics-Technologien und ihre Anwendungen zu verstehen
- Konzepte von Genomik, Transkriptomik, Proteomik und Metabolomik zu erklären
- Omics-Studien zu planen und verschiedene Omics-Datentypen zu verstehen
- öffentliche Omics-Repositorien wie TCGA, GEO und PRIDE zu nutzen
- grundlegende Konzepte von Linux und bioinformatischen Workflows anzuwenden
- RNA-seq-Workflows und Qualitätskennzahlen der Sequenzierung zu verstehen
- differenzielle Genexpressionsanalysen durchzuführen
- Ergebnisse von Pathway-Enrichment-Analysen zu interpretieren
- Proteomik-Technologien und massenspektrometrische Daten zu verstehen
- die Prinzipien der Normalisierung von Metabolomikdaten zu verstehen
- Proteomik- und Metabolomikdaten zu visualisieren
- Prinzipien der Multi-Omics-Integration anzuwenden
- Netzwerkanalysen und systembiologische Ansätze zu verstehen
- Omics-Daten im Kontext von Präzisionsmedizin und Wirkstoffforschung zu interpretieren
- in einem Mini-Projekt mit einem öffentlichen Multi-Omics-Datensatz zu arbeiten
- Ergebnisse von Omics-Analysen wissenschaftlich zu präsentieren
Zielgruppe
Dieser Kurs eignet sich besonders für:
- Master-Studierende und Promovierende
- wissenschaftliche Hilfskräfte und technische Assistentinnen und Assistenten
- Forschende aus den Life Sciences mit Interesse an Omics-Datenanalyse
- Studierende der Biomedizin, Biotechnologie, Molekularbiologie, Genetik und Bioinformatik
- Forschende, die mit Transkriptomik-, Proteomik-, Metabolomik- oder Multi-Omics-Daten arbeiten
- Fachkräfte aus Biotechnologie, Pharmaindustrie, Diagnostik und translationaler Forschung
- Teilnehmende mit Interesse an Präzisionsmedizin, Biomarker-Identifizierung, Krebsforschung, Immunologie und Systembiologie
Kursprogramm
Tag 1: Einführung in Omics-Technologien & Versuchsplanung
Schwerpunkt: Multi-Omics-Konzepte und Studienplanung
| Uhrzeit | Inhalt | Format |
|---|---|---|
| 09:00–09:30 | Begrüßung & Kursüberblick | Vortrag |
| 09:30–10:30 | Einführung in Genomik, Transkriptomik, Proteomik & Metabolomik | Vortrag |
| 10:30–10:45 | Kaffeepause | |
| 10:45–12:00 | Versuchsplanung für Omics-Studien & Datentypen | Vortrag |
| 12:00–13:00 | Mittagspause | |
| 13:00–14:30 | Biologische Datenbanken & öffentliche Omics-Repositorien: TCGA, GEO und PRIDE | Vortrag + Demo |
| 14:30–14:45 | Kaffeepause | |
| 14:45–16:00 | Praxis: Einführung in bioinformatische Workflows & Linux-Grundlagen | Praxis |
| 16:00–16:30 | Fragerunde & Tagesabschluss | Diskussion & Fragerunde |
Tag 2: Transkriptomik & Genexpressionsanalyse
Schwerpunkt: RNA-seq und differenzielle Expression
| Uhrzeit | Inhalt | Format |
|---|---|---|
| 09:00–09:30 | Überblick Tag 2 & Diskussion des Arbeitsablaufs | Fragerunde |
| 09:30–10:30 | RNA-seq: Prinzipien & experimenteller Ablauf | Vortrag |
| 10:30–10:45 | Kaffeepause | |
| 10:45–12:30 | Praxis: Qualitätskontrolle von Sequenzierdaten – FASTQ/QC-Kennzahlen | Computer-Session |
| 12:30–13:30 | Mittagspause | |
| 13:30–15:00 | Differenzielle Genexpressionsanalyse | Vortrag + Praxis |
| 15:00–15:15 | Kaffeepause | |
| 15:15–16:30 | Pathway-Enrichment & funktionelle Interpretation | Computer-Session |
| 16:30–17:00 | Tagesabschluss | Diskussion |
Tag 3: Analyse von Proteomik- & Metabolomikdaten
Schwerpunkt: Protein- und Metabolitenprofilierung
| Uhrzeit | Inhalt | Format |
|---|---|---|
| 09:00–10:00 | Einführung in Proteomik-Technologien & Massenspektrometrie | Vortrag |
| 10:00–10:15 | Kaffeepause | |
| 10:15–12:00 | Verarbeitung von Proteomikdaten & Proteinidentifizierung | Vortrag + Demo |
| 12:00–13:00 | Mittagspause | |
| 13:00–14:30 | Einführung in die Metabolomik & Datennormalisierung | Vortrag |
| 14:30–15:30 | Praxis: Visualisierung von Proteomik-/Metabolomikdaten | Computer-Session |
| 15:30–15:45 | Kaffeepause | |
| 15:45–16:30 | Biologische Interpretation & Strategien zur Biomarker-Identifizierung | Diskussion |
| 16:30–17:00 | Tagesabschluss | Diskussion |
Tag 4: Multi-Omics-Integration & Systembiologie
Schwerpunkt: Integrative Analyse
| Uhrzeit | Inhalt | Format |
|---|---|---|
| 09:00–10:00 | Prinzipien der Multi-Omics-Integration | Vortrag |
| 10:00–10:15 | Kaffeepause | |
| 10:15–12:00 | Netzwerkanalyse & systembiologische Ansätze | Vortrag + Demo |
| 12:00–13:00 | Mittagspause | |
| 13:00–14:30 | Praxis: Integrative Analyse von Omics-Daten | Computer-Session |
| 14:30–15:30 | Datenvisualisierung & Interpretation biologischer Netzwerke | Computer-Session |
| 15:30–15:45 | Kaffeepause | |
| 15:45–16:30 | Anwendungen in Präzisionsmedizin & Wirkstoffforschung | Vortrag |
| 16:30–17:00 | Tagesabschluss | Diskussion |
Tag 5: Translationale Omics & Mini-Projekt
Schwerpunkt: Praxisanwendungen und Projektpräsentation
| Uhrzeit | Inhalt | Format |
|---|---|---|
| 09:00–10:00 | Omics in Krebsforschung, Immunologie & personalisierter Medizin | Vortrag |
| 10:00–10:15 | Kaffeepause | |
| 10:15–12:00 | Mini-Projekt: Analyse eines öffentlichen Multi-Omics-Datensatzes | Gruppenarbeit |
| 12:00–13:00 | Mittagspause | |
| 13:00–14:30 | Dateninterpretation & Vorbereitung einer wissenschaftlichen Präsentation | Gruppenarbeit |
| 14:30–15:30 | Gruppenpräsentationen & wissenschaftliche Diskussion | Präsentation & Diskussion |
| 15:30–15:45 | Kaffeepause | |
| 15:45–16:15 | Zukunftstrends: KI & maschinelles Lernen in der Omics-Analyse | Vortrag |
| 16:15–16:30 | Abschluss, Feedback & Zertifikate | Fragerunde |
Ihr Mehrwert
Die Teilnehmenden gewinnen:
- einen fundierten Überblick über Omics-Technologien und Studiendesign
- praktische Erfahrung mit öffentlichen Omics-Repositorien
- Verständnis von Transkriptomik und RNA-seq-Workflows
- Kompetenz in der differenziellen Genexpressionsanalyse
- Verständnis von Pathway-Enrichment und funktioneller Interpretation
- einführendes Wissen zur Analyse von Proteomik- und Metabolomikdaten
- Erfahrung in der Visualisierung von Omics-Daten
- Verständnis von Multi-Omics-Integration und Systembiologie
- Einblick in die Interpretation biologischer Netzwerke
- Wissen über Strategien zur Biomarker-Identifizierung
- Verständnis der Anwendungen von Omics in Präzisionsmedizin und Wirkstoffforschung
- Erfahrung aus einem Mini-Projekt mit einem öffentlichen Multi-Omics-Datensatz
- Vorbereitung auf fortgeschrittene Projekte in Omics, Bioinformatik und translationaler Forschung
Kursdetails
- Ort: XTech Academy, Heidelberg
- Dauer: 5 Tage
- Format: Computergestützter Praxiskurs
- Niveau: Mittelstufe
- Preis (inkl. MwSt.): Industriepreis 3.450 € · Frühbucherpreis 2.950 € · Studierendenpreis 2.400 €
- Schwerpunkte: Omics-Technologien, Transkriptomik, RNA-seq, Proteomik, Metabolomik, öffentliche Repositorien, differenzielle Expression, Pathway-Enrichment, Multi-Omics-Integration, Systembiologie, Biomarker-Identifizierung, Präzisionsmedizin, Wirkstoffforschung, KI, maschinelles Lernen und Analyse öffentlicher Multi-Omics-Datensätze
